三年前，身為警察臥底的李菲兒父親李勇平與犯罪集團分子高志祥在一次抓捕行動(dòng)中失蹤，高志祥三年后回來(lái)要找出告發(fā)他的叛徒，于是將目標盯上了李勇平的女兒李菲兒。警方覺(jué)察到這一動(dòng)向立即派出警察肖喆以網(wǎng)絡(luò )工程師（電腦高手）的身份加入到李菲兒的團隊里，與曾是李勇平的手下警察張小帥一明一暗保護李菲兒。在這過(guò)程中， 一個(gè)自詡英俊與智慧并重，英雄與俠義的化身的小報記者方旭為了追求心目中的女神李菲兒，天天糾纏不休也被卷入到這一斗爭中，兩人上演了許多啼笑皆非的故事。李菲兒遺傳了他父親果敢、睿智的基因并深信他父親還活著(zhù)，為了揭開(kāi)父親失蹤之迷與方旭、肖喆經(jīng)歷了眾多的危險，在警方的幫助下他們均化險為夷并破獲了一個(gè)又一個(gè)案件，將犯罪分子一一繩之于法，同時(shí)李勇平的失蹤之迷也慢慢被揭開(kāi).......

喧囂吵鬧的都市一隅，不起眼的角落里，經(jīng)營(yíng)著(zhù)一家從午夜十二點(diǎn)到次日七點(diǎn)營(yíng)業(yè)的小飯館，被人稱(chēng)作深夜食堂。食堂的菜單僅有大鍋菜、啤酒和白酒三樣，當然如果客人有什么需要，老板也會(huì )專(zhuān)門(mén)為他們烹制。食堂的老板（黃磊 飾）不茍言笑，卻用一顆溫暖真誠的心對待每一位走入食堂的客人。白天，都市男女或者光鮮亮麗，或者狼狽畏縮。到了夜晚，他們便逐一卸去一天的偽裝，坐在食堂的角落里，吃喝談笑，插科打諢，吐槽著(zhù)坎坷的人生和不公的命運，滿(mǎn)身是血雙目含淚卻仍憧憬未知但可能美好的未來(lái)。深夜食堂，是為每一個(gè)全力而行的人們喘息療傷的綠島……