在1999年，一艘外星宇宙戰艦墜落到了地球，人們用了了十年的時(shí)間修復并取名為MACROSS。2009年，MACROSS要塞正在舉辦一場(chǎng)偶像歌星林明美（飯島真理 配音）的演唱會(huì )，突然空襲警報響起，要塞開(kāi)始了變形。戰斗中，一條輝（長(cháng)谷有洋 配音）駕駛著(zhù)變形戰斗救下一名少女，戰機卻由于速度過(guò)快撞進(jìn)外層艙室。安定后，輝發(fā)現救得是林明美。倆人相識后，為使明美高興，輝偷開(kāi)教練機帶著(zhù)明美去兜風(fēng)。敵人趁機出現，好在朋友這時(shí)挺身相救，經(jīng)過(guò)一場(chǎng)混戰，輝和早瀨未沙（土井美加 配音）醒過(guò)來(lái)，發(fā)現在一個(gè)荒蕪的星球上。他們了解到，五十萬(wàn)年前，一個(gè)叫普羅多的古代文明發(fā)展到頂盛時(shí)，已經(jīng)可以借遺傳密碼無(wú)性繁殖后代，于是國家分裂為由男性組成的杰特拉帝和由女性組成的赫而特蘭帝開(kāi)始了長(cháng)達數萬(wàn)年的戰爭。在戰爭中文明急劇衰退了，曾經(jīng)偉大的文化被遺忘殆盡，退化成了只會(huì )戰斗的種族，為了維護和平，他們將會(huì )采取怎樣的行動(dòng)…… 《超時(shí)空要塞》是1982至83年間播出的一部電視動(dòng)畫(huà)，本片在其基礎上精簡(jiǎn)改編而成。
