銜接上季。忍者們離開(kāi)神秘島，但妮婭的水系元素突然失去了控制，在尋找問(wèn)題之時(shí)，突然收到來(lái)自海底的一個(gè)能量波，于是闖入了水下五千英尋的無(wú)盡大海神殿，里面生活著(zhù)許多海怪（莫羅匹恩人），他們被一個(gè)叫特里瑪的章魚(yú)怪領(lǐng)導著(zhù)，但是他的兒子卡爾瑪卻內心邪惡，他決定用兩個(gè)護身符（風(fēng)暴護身符和海浪護身符）來(lái)喚醒海上巨蟒“沃杰拉”，來(lái)造出驚人的破壞力?？柆敒榱藢?shí)現計劃，害死了他的爸爸并嫁禍忍者，后得到兩個(gè)護身符，喚醒了沃杰拉，水淹忍者城。忍者城居民的處境十分危險。本多瑪擊碎卡爾瑪的權杖，卡爾瑪失去對沃杰拉的控制，被沃杰拉吞食。妮雅為了擊敗沃杰拉，不顧自身與海洋融為了一體，最終打敗了沃杰拉，妮雅將海水帶出忍者城，自己也留在了海水中。
